Ya sea por el efecto de un conjuro u otra fuente como las habilidades sobrenaturales los modificadores, tanto penalizadores como bonificadores, funcionan igual. Aquellos de una misma fuente, como un conjuro o una habilidad sobrenatural, o de un mismo tipo como mejora, profano o competencia se solapan haciendo que solo se aplique el resultado mayor.

Hay algunas pocas excepciones como los modificadores de los tipos de esquiva y circunstanciales que siempre se apilan además de unos pocos casos en los que especifica que es un efecto que se apila.

En el caso de múltiples lanzamientos del conjuro de rayo debilitante en un mismo objetivo confirmo lo dicho por Kether, se solapa ya que es una misma fuente y no se indica que haga lo contrario en la descripción del conjuro.

En este enlace http://www.d20srd.org/srd/theBasics.htm tienes más información sobre el tema de los modificadores, quizás te ayude.